产品货号:
YTB4634
中文名称:
Oligo(dT)25磁珠
英文名称:
BalbMag Oligo(dT)25 Magnetic Beads
产品规格:
1mL|5mL|20mL|100mL
发货周期:
1~3天
产品价格:
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本制品是一种使用Oligo(dT)25包被的磁珠,可与mRNA等尾部的poly(A)互补配对,用于稳定、高效、便捷地直接从动物组织或培养的动物细胞中或从总RNA中快速分离纯化获得高纯度完整的带有poly(A)的mRNA等RNA的磁珠。本制品分离纯化的poly(A) RNA中也可包含带有poly(A)的lncRNA等,但通常主要为mRNA,因此也常被称为mRNA磁珠。
本制品磁珠粒径约为200nm,浓度约为5mg/mL。每mg磁珠偶联的Oligo (dT)25约为300-400pmol,每mg磁珠可纯化约2~3μg mRNA等poly(A) RNA,即每毫升 磁珠可以纯化约10~15μg mRNA等poly(A) RNA。
使用Oligo(dT)25磁珠纯化的带有poly(A)的mRNA、lncRNA等,可直接应用于RT-PCR、qPCR、高通量测序、mRNA文库的构建、mRNA的m6A等修饰分析、固相cDNA文库构建、Northern blot分析、RACE等分子生物学实验,还可用于mRNA疫苗的研发,如mRNA疫苗的纯化、3' Poly A尾长度检测时Poly A尾短链的分离纯化等。
一个典型的哺乳动物细胞中,四种主要的大分子的质量和占比为:
大分子 | 含量 | 占比 |
RNA | ~20pg | 1% |
DNA | ~7pg | 0.3% |
protein | ~500pg | 20% |
polysaccharide (多糖) | ~2μg | 78.7% |
组分 | 1mL | 5mL | 20mL | 100mL |
BalbMag Oligo(dT)25磁珠 | 1mL | 5mL | 20mL | 100mL |
说明书 | 1份 |
保存:2~8℃,有效期1年。
- BalbMag Oligo (dT)25磁珠长期不使用时,可以-20℃保存,-20℃可以保存更长时间。
- 操作过程要严格保证无RNA酶和DNA酶污染。对于操作环境中RNase的去除,推荐使用核酸酶喷雾清除剂以去除实验桌面上或其它接触面上的RNase。
- 本制品的所用试剂和耗材都要求是RNase-free和DNase-free的,操作时应小心,避免被污染。如果耗材可能有RNase污染,可考虑用0.01%的DEPC水浸泡过夜,然后高温高压灭菌并烘干。如果可能有DNase污染,通常高温高压灭菌可以使DNase灭活。
- 分装或使用磁珠时,请适当涡旋震荡或反复颠倒以确保磁珠充分混匀。
- 磁分离前应适度震荡离心管使磁珠充分分散后再靠近磁场。如果出现磁珠挂壁现象,可以在磁珠聚集后晃动管内液体,使挂壁的磁珠流下。
- 请使用推荐的样本量。如果样本量过大,可能造成磁珠聚集,会影响洗涤进而影响提取获得的mRNA纯度。发生磁珠聚集时,洗涤时需尽量分散磁珠,这样可有效改善提取效果。如果发生磁珠聚集现象,建议在后续实验中适当减少总样本量。
- 由于mRNA容易降解,提取获得的mRNA推荐尽快用于RT-PCR等后续实验。如果不能尽快使用,需要-80℃保存。
本制品的原理和主要操作流程如图1所示。BalbMag Oligo (dT)25磁珠表面共价修饰了25聚dT序列即Oligo (dT)25,当真核细胞、动植物组织的裂解液或提取的总RNA与BalbMag Oligo (dT)25磁珠混合后,磁珠表面的寡聚dT序列与mRNA等3'端的poly(A)进行碱基配对而特异性结合,然后在外界磁场的作用下,磁珠与相应溶液可以快速而高效地分离,经洗涤充分去除杂质,最后用洗脱液将mRNA等从磁珠上洗脱下来,即可获得高纯度完整mRNA等带有poly(A)的RNA。
图1.Oligo(dT)25磁珠(货号:YTB4634)用于mRNA提取的工作原理示意图。
本制品盒具有提取效果稳定、纯度高、速度快、操作便捷等优点。本制品的mRNA提取体系经过反复测试和优化,能分离纯化获得总RNA中90%以上的mRNA,能从106个细胞中提取约0.1~1μg mRNA,20mg小鼠肝组织能提取约0.2~2μg mRNA,20mg小鼠肺组织能提取约0.1~1μg mRNA。仅需裂解、结合、洗涤、洗脱等简单的操作,整个纯化过程不超过15分钟即可完成。所有操作都在同一个离心管中完成,操作便捷。提取的total RNA使用本制品进行mRNA的纯化效果参考图2。
图2.本制品用于从总RNA中纯化mRNA的效果图。使用柱式动物RNA提取试剂盒提取293T细胞的总RNA,同时使用本制品进行mRNA的纯化,然后使用一步法荧光定量RT-PCR试剂盒(SYBR Green)进行qRT-PCR检测,使用Actin、B2M和GAPDH的三对内参引物对比总RNA (Total RNA)和纯化的mRNA的Ct值。图中可见mRNA纯化前后的Ct值基本一致,说明mRNA的纯化效果接近100%。实际结果会因实验条件、检测仪器等的不同而存在差异,图中数据仅供参考。
- 准备工作:
- 缓冲液的准备。根据实验需要配制相关缓冲液,参考配方如下配制:
Binding Buffer 20mM Tris-HCl (pH7.5),1M LiCl,2mM EDTA Lysis Buffer 100mM Tris-HCl (pH7.5),500mM LiCl,10mM EDTA,1% LiDS,5mM DTT Washing Buffer I 10mM Tris-HCl (pH7.5),150mM LiCl,1mM EDTA,0.1% LiDS Washing Buffer II 10mM Tris-HCl (pH7.5),150mM LiCl,1mM EDTA Elution Buffer 10mM Tris-HCl (pH7.5) - 试剂和耗材的RNase-free要求参见注意事项;试剂在使用时平衡至室温,如有沉淀,可37℃预热10分钟。
- 细胞样品的准备。
- 贴壁细胞用PBS洗涤一次;悬浮细胞1000~2000×g室温离心5分钟,弃上清,用PBS洗涤一次。
- 按照细胞量加入推荐的裂解液。通过移液器吹打多次,裂解细胞至溶液变粘稠。
- 选做:加入溶液裂解液后样品可能会比较粘稠,可适当超声或使用1mL注射器反复抽吸打断基因组DNA从而使粘稠感消失。此操作会产生泡沫,但不影响mRNA的得率。
- 4℃以14000×g离心5分钟,并将上清转移至一个新的离心管。上清可用于mRNA纯化,或保存在-80℃备用。
- 贴壁细胞用PBS洗涤一次;悬浮细胞1000~2000×g室温离心5分钟,弃上清,用PBS洗涤一次。
- 动物组织样品的准备。
- 取所需量的动物组织,置于液氮中研磨成粉末,立即加入推荐量的裂解液。也可将组织置于1.5mL离心管中,迅速加入推荐量的冰浴预冷的裂解液,用微型电动匀浆器匀浆,或者用普通玻璃匀浆器进行匀浆。
- 4℃以14000×g离心5分钟,并将上清转移至一个新的离心管。上清可用于mRNA纯化,或保存在-80℃备用。
- 取所需量的动物组织,置于液氮中研磨成粉末,立即加入推荐量的裂解液。也可将组织置于1.5mL离心管中,迅速加入推荐量的冰浴预冷的裂解液,用微型电动匀浆器匀浆,或者用普通玻璃匀浆器进行匀浆。
- BalbMag Oligo (dT)25磁珠的准备。
- 将磁珠溶液从4℃冰箱取出,适当涡旋震荡或反复颠倒以确保磁珠充分混匀。参考下表,根据总RNA量和总细胞量或组织重量,取适量的BalbMag Oligo (dT)25磁珠悬液至一洁净离心管中。
Total RNA Beads required Washing Buffer II 1~10μg 20μL 200μL each time 10~30μg 40μL 200μL each time 30~50μg 100μL 200μL each time Cell number Tissue mass Lysis Buffer Beads Washing Buffer I Washing Buffer Ⅱ <5×105 <5mg 100μL 20μL 500μL 500μL each time 1~2×106 5~20mg 300μL 40μL 500μL 500μL each time 3~5×106 20~50mg 600μL 100μL 500μL 500μL each time - 无论磁珠用量多少,按照每个样品200μL结合液的量,加入适量结合液洗涤磁珠,用移液器轻轻吹打重悬磁珠。置于磁力架上分离30秒,去除上清。重复本步骤1次。
- 如果样品数量超过5个,可以考虑将适量磁珠悬液先直接置于磁力架上分离30秒,去除上清,然后根据样品数量再加入适量结合液洗涤2次。
- 按照每个样品100μL结合液的量,加入适量溶液结合液重悬磁珠。
- 将磁珠溶液从4℃冰箱取出,适当涡旋震荡或反复颠倒以确保磁珠充分混匀。参考下表,根据总RNA量和总细胞量或组织重量,取适量的BalbMag Oligo (dT)25磁珠悬液至一洁净离心管中。
- 缓冲液的准备。根据实验需要配制相关缓冲液,参考配方如下配制:
- 从细胞或组织样品中分离纯化mRNA:
- 取上述制备好的细胞或组织样品与100μL洗涤后重悬的磁珠在室温下旋转混合5分钟。
- 置于磁力架上分离1分钟,去除上清。
- 室温下用500μL洗涤液I洗涤磁珠,磁分离30秒,去上清。
- 室温下用500μL洗涤液Ⅱ洗涤磁珠,磁分离30秒,去上清。重复本步骤1次。
- 根据后续实验需求,进行mRNA的洗脱:
- 取上述制备好的细胞或组织样品与100μL洗涤后重悬的磁珠在室温下旋转混合5分钟。
- 从Total RNA中纯化mRNA:
- 取100μL含有20μg Total RNA的样品与100μL结合液混合。
- 如果20μg Total RNA不足100μL,可以用DEPC水或其它适当Nuclease-free溶液补足至100μL。
- 65℃孵育2分钟以打开RNA的二级结构,孵育结束后迅速置于冰上。
- 将该200μL混合液与100μL洗涤后重悬的磁珠在室温下旋转混合5分钟。
- 置于磁力架上分离1分钟,去除上清。
- 室温下用200μL洗涤液Ⅱ洗涤磁珠,磁分离30秒,去上清。重复本步骤1次。
- 根据后续实验需求,进行mRNA的洗脱:
- 取100μL含有20μg Total RNA的样品与100μL结合液混合。
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